劇版《顯微鏡下的大明》已經播放到了第五集，現在看來這部劇的主線已經非常明朗了。
劇中主線劇情講的是男主角帥家默的父親帥敦誠當年是仁華縣「戶房」的一位書手，這個職位雖然算不上什麼官，但是在當地卻十分重要。
明朝的府、縣兩級政府里面，具體政務的執行機構叫作「三班六房」，「六房」與中央六部相對應，「六房」的職位往往為本地胥吏所把持。
「六房」中的戶房，分管錢糧，能在戶房工作絕對是個肥差，嘉靖年間的官員霍與瑕曾寫道： 「各縣各戶房糧科，年年派糧，時時作弊。」可見當時戶房的混亂。
帥敦誠在仁華縣戶房擔任書手期間，發現了絲絹稅的問題，在他想要徹查這件事的時候，被殺人滅口，并且還按上了貪腐的罪名。
帥家默長大成人之后，便想借著查絲絹稅的機會，為父親伸冤。
除了上面這一條主線以外，在前五集的內容里還有一條暗線貫穿始終。
在第四集的時候，任主簿在后堂當著其他三位知縣的面，給黃知府看自己的靴子時說道： 百姓要交的稅除了春夏兩季的正稅和均徭之外，還有各色雜泛，一年到頭不停，一戶三口之家，春耕秋收，連半兩銀子都剩不下，第二年買種子還要借錢。
任主簿說到這里的時候，毛知縣在一旁情緒比較激動的說出了四個字「 這苛政猛……」，雖然只說了四個字就被一旁的鄧知縣打斷了，改口說了句「 哀民生之多艱啊」。
但是大家都心知肚明，毛知縣要說的話就是「 苛政猛于虎」！
而這句話才是《顯微鏡下的大明》真正的主題，也是這部劇真正的主線。
在全劇開始的第一場戲，帥家默給老鄉家計算地畝，地契上確實是寫著四畝地，但怎麼計算都是三畝六分，兩家人為了這消失的四分地大打出手，帥家默百思不得其解。
直到帥家默進入架閣庫，他才恍然大悟，并不是田地少了四分，而是地契上面多了四分。
有了這多出的四分地，每年就可以多收四分地的稅。
按照這個比例來看，相當于每一畝地的地契上都會比實際多出一分，九分的地交著十分的稅，那麼整個仁華府有多少地？每年會多收多少稅？
雖然這「空氣稅」看起來已經夠荒唐了，但是與劇中的絲絹稅相比還是小巫見大巫。
絲絹稅原本是戰時臨時征稅，戰爭早就結束了，可這絲絹稅居然順延了下來，成了固定稅目。
更離譜的是仁華這個地區根本就不養蠶，他們要繳絲絹稅，每年都只能是賣了糧食，折成銀子，然后用銀子從浙江等地回購絲絹，進行繳稅，這兩道手續讓繳稅的成本翻了一倍。
這還只是稅金，沒有將運輸費用算在里面，在劇中帥家默和鄧知縣對辯的時候就提到了運輸費用的問題。
鄧知縣說了之前是靠「 征調免費徭役」來負責運輸，重點就在這「免費」兩個字上，押送這麼多絲絹上路，肯定需要壯勞力，在那個時代，家中一個壯勞力被免費征調了，可能比讓這個家庭多繳點稅款還要難以讓人接受。
鄧知縣接著又說了 「圣上因為憐黎民之苦，改為以銀代役，只讓老百姓繳納一定數額的銀錢給官府」。明明是讓百姓多繳了稅費，卻說得這麼冠冕堂皇，百姓還要因此而叩謝圣恩。
那麼如果百姓堅持不繳稅會怎麼樣呢？程仁清對豐碧玉說得這番話可供參考。
程仁清勸說豐碧玉不要在讓弟弟和帥家默插手絲絹稅的事，并給她預想了一下如果執意插手的后果， 「今天來您的同陽分號查查你們用的豬肉是不是瘟豬肉，明天再到你們的萬成分號查查賬簿有沒有問題，后天金安再給你發個帖子，點你應一個皇差，讓你給京城免費上三千斤上好的肘子」。
總結一句話，就是如果你不按照官府的要求來辦，官府有很多辦法來收拾你，即使像豐氏這樣當地的大型連鎖機構，官府想要讓你倒閉，也是分分鐘的事情。
那麼如果百姓繳了稅款是不是會好一些呢？可以看看任主簿的這番話。
任主簿在后堂對黃知府說過：「 那些農民會變賣自己的積蓄和家畜勉強交上這一筆稅，但是一貧如洗的他們只能被迫去借高利貸，要麼被迫讓土地賣掉淪為佃戶，要麼拋荒逃亡，要麼把小老和稅吏打殺，然后落草去做山賊，每加一次稅，這樣的事都會重復一次。」
也許有人會認為任主簿的這段話有點威脅黃知府的意思，但是在原著里面接下來發生的那些事情，證明了他真的不是危言聳聽，而《顯微鏡下的大明》這本書并不是作者編造出來的小說，而是歷史紀實。
很多網友說劇版《顯微鏡下的大明》第一集鋪墊太多，進主線太慢，可實際上這部劇從第一場戲就已經開始進入主線了，這個主線就是「 苛政猛于虎」。